Quelle est la caractéristique de l'extrémité 5' de l'ARN?
Elle contient un groupe phosphate.
p.5
Types d'ARN et leurs fonctions
Quels types d'ARN sont les plus abondants dans la cellule?
Les ARN ribosomiques (ARNr) et les ARN de transfert (ARNt).
Qu'est-ce que la structure primaire de l'ARN?
Séquence en nucléotides dans l'ARN.
Quelle est la structure formée par l'appariement des bases dans l'ARN?
Structure tige-boucle (ou épingle à cheveux).
p.7
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la séquence du brin matrice de l'ADN?
3' T A A T G C T G G A T G C G T A 5'
p.1
Différences entre ARN et ADN
Quelle est la différence principale entre l'ARN et l'ADN en termes de sucre contenu dans leurs nucléotides?
L'ARN contient du ribose, tandis que l'ADN contient du déoxyribose.
p.1
Différences entre ARN et ADN
Que signifie dNTP dans le contexte de l'ADN?
Déoxynucléotide TriPhosphate.
p.3
Liaisons phosphodiester dans l'ARN
Qu'est-ce qu'une liaison phosphodiester?
Une liaison covalente extrêmement forte.
p.3
Liaisons phosphodiester dans l'ARN
Entre quels carbones se forment les liaisons phosphodiester dans l'ARN?
Entre le carbone 3' d'un nucléotide et le carbone 5' du suivant.
p.5
Types d'ARN et leurs fonctions
Quels sont les types d'ARN codants?
Les ARN messagers (ARNm).
Qu'est-ce que la structure secondaire de l'ARN?
Repliement sur lui-même avec appariement des bases, formant une structure tige-boucle.
p.7
Transcription de l'ADN en ARN
À quel brin de l'ADN la chaîne d'ARN synthétisée est-elle identique?
Au brin codant (ou brin complémentaire)
p.8
Transcription de l'ADN en ARN
Qu'est-ce qu'un gène?
Une région d'ADN portant l'information pour la synthèse d'un ARN ou d'une protéine.
p.8
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quels sont les éléments clés d'un gène?
Promoteur et terminateur.
p.8
Transcription de l'ADN en ARN
Comment est symbolisé un gène chez les procaryotes?
En italique ou souligné, par exemple hisA ou hisA.
p.8
Transcription de l'ADN en ARN
Comment est symbolisée une protéine chez les procaryotes?
Avec la première lettre en majuscule, par exemple HisA.
p.9
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quels sont les éléments clés d'une unité de transcription?
Promoteur et terminateur.
p.10
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quel est le rôle du terminateur dans un opéron?
Le terminateur est la région de l'ADN où se termine la transcription.
p.10
Types d'ARN et leurs fonctions
Quels sont les produits de la traduction d'un ARN messager polycistronique?
Plusieurs protéines distinctes.
p.11
Types d'ARN et leurs fonctions
Quelle est la fonction de l'ARN messager (ARNm)?
L'ARN messager (ARNm) est traduit en protéine.
p.14
ARN polymérases et leur fonctionnement
De quoi est composé le complexe multi-protéique de l'ARN polymérase bactérienne?
De plusieurs sous-unités.
p.15
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quelle est la fonction du domaine carboxy-terminal (αCTD) de la sous-unité α?
Module de fixation à l'ADN (séquence « UP »)
p.16
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quel est le rôle des sous-unités β et β' dans l'ARN polymérase bactérienne?
Elles contiennent le site catalytique de l'enzyme, interagissent directement avec l'ADN, portent les sites de fixation des nucléosides triphosphates (NTP), et sont nécessaires au démarrage de la transcription et à la formation de l'ARN.
p.16
ARN polymérases et leur fonctionnement
Pourquoi les sous-unités β et β' de l'ARN polymérase bactérienne sont-elles des cibles pour certains antibiotiques?
Parce qu'elles contiennent le site catalytique de l'enzyme et interagissent directement avec l'ADN.
p.17
ARN polymérases et leur fonctionnement
La sous-unité σ de l'ARN polymérase est-elle dissociable ?
Oui, elle est dissociable.
p.2
Différences entre ARN et ADN
Quelle base remplace la thymine dans l'ARN par rapport à l'ADN ?
L'uracile remplace la thymine.
Quelle est la caractéristique de l'extrémité 3' de l'ARN?
Elle contient un groupe hydroxyle.
p.5
Types d'ARN et leurs fonctions
Quels sont les types d'ARN non codants?
Les ARN ribosomiques (ARNr), les ARN de transfert (ARNt), et les petits ARN non codants.
p.7
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la séquence du brin codant de l'ADN?
5' A T T A C G A C C T A C G C A T 3'
p.7
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la séquence de l'ARN synthétisé?
5' A U U A C G A C C U A C G C A U 3'
p.10
Types d'ARN et leurs fonctions
Qu'est-ce qu'un opéron chez les procaryotes?
Une région d'ADN transcrite en un seul ARN messager mais contenant l'information nécessaire à la synthèse de plusieurs protéines.
Comment l'information génétique est-elle organisée dans un opéron?
L'information génétique est organisée en segments codant pour plusieurs protéines, transcrits en un seul ARN messager.
p.11
Initiation et élongation de la transcription
Quels sont les trois étapes principales de la transcription?
Initiation, élongation, terminaison.
p.11
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quel est le rôle du terminateur dans la transcription?
Le terminateur est la séquence d'ADN qui signale la fin de la transcription.
p.11
Types d'ARN et leurs fonctions
Quels types d'ARN sont produits par la transcription?
ARN ribosomique, ARN de transfert, ARN messager.
p.12
ARN polymérases et leur fonctionnement
Les ARN polymérases nécessitent-elles des amorces pour la synthèse de l'ARN?
Non, elles ne nécessitent pas d'amorces.
p.13
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quelle est la différence principale entre les ARN polymérases des eubactéries et des eucaryotes?
Les ARN polymérases des eubactéries ont moins de sous-unités comparées à celles des eucaryotes.
p.15
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quelle est la fonction du domaine amino-terminal (αNTD) de la sous-unité α?
Dimérisation des sous-unités α et assemblage avec les sous-unités β et β’
p.14
Initiation et élongation de la transcription
Quelle est la fonction du core-enzyme de l'ARN polymérase bactérienne?
Élongation et terminaison de la transcription.
p.17
ARN polymérases et leur fonctionnement
À quoi s'associe la sous-unité σ de manière réversible ?
Au « core » enzyme pour former l'holoenzyme (α2ββ'ωσ).
p.18
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quels sont les rôles des facteurs σ alternatifs dans une bactérie?
Ils ont des fonctions spécialisées.
p.18
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quels sont les noms des facteurs σ principaux et alternatifs chez Escherichia coli?
σ^70 (RpoD) est le principal, et les alternatifs sont σ^38 (RpoS), σ^32 (RpoH), σ^28 (FliA), σ^24 (RpoE), σ^19 (FecI), et σ^54 (RpoN).
p.19
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelles sont les régions clés du promoteur?
La région -35 et la région -10.
p.27
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce qui se passe lors de l'enroulement de l'ADN correspondant au promoteur autour de l'ARN polymérase?
Formation d'un complexe intermédiaire.
p.9
Transcription de l'ADN en ARN
Qu'est-ce qu'un gène?
Une région d'ADN portant l'information pour la synthèse d'un ARN ou d'une protéine.
p.10
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quel est le rôle du promoteur dans un opéron?
Le promoteur est la région de l'ADN où commence la transcription.
p.10
Types d'ARN et leurs fonctions
Qu'est-ce qu'un ARN messager polycistronique?
Un ARN messager qui contient l'information pour la synthèse de plusieurs protéines.
p.11
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quel est le rôle du promoteur dans la transcription?
Le promoteur est la séquence d'ADN où l'ARN polymérase se lie pour initier la transcription.
p.12
ARN polymérases et leur fonctionnement
Combien d'ARN polymérases existent chez les eucaryotes?
3 ARN polymérases : I, II et III.
p.12
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quelle est la structure des ARN polymérases?
Structure en « pince de crabe ».
p.14
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quelle est la vitesse de synthèse des ARN messagers par l'ARN polymérase d'Escherichia coli?
50 nucléotides par seconde.
p.15
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quels sont les deux domaines de la sous-unité α de l'ARN polymérase bactérienne?
Le domaine amino-terminal (αNTD) et le domaine carboxy-terminal (αCTD)
p.14
Initiation et élongation de la transcription
Quelle est la fonction de l'holo-enzyme de l'ARN polymérase bactérienne?
Initiation de la transcription.
p.16
Initiation et élongation de la transcription
Pourquoi les sous-unités β et β' de l'ARN polymérase bactérienne sont-elles importantes pour la transcription?
Elles sont nécessaires au démarrage de la transcription et à la formation de l'ARN.
p.16
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quels sont les sites portés par les sous-unités β et β' de l'ARN polymérase bactérienne?
Les sites de fixation des nucléosides triphosphates (NTP).
p.16
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quel est le rôle de la sous-unité ω dans l'ARN polymérase bactérienne?
Elle joue un rôle dans l'assemblage de l'ARN polymérase en participant au recrutement de la sous-unité β'.
p.19
Rôle des promoteurs et terminateurs
Qu'est-ce qu'un promoteur dans le contexte de la transcription de l'ADN?
Un signal pour initier la transcription, localisé en amont du site +1, et qui n'est pas transcrit.
p.19
Transcription de l'ADN en ARN
Où commence la transcription sur l'ADN?
Au nucléotide +1, appelé site de démarrage.
p.19
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelle est la fonction du terminateur dans la transcription?
Arrêter la transcription.
p.21
Rôle des promoteurs et terminateurs
Qu'est-ce qu'un promoteur « faible »?
Un promoteur avec des séquences éloignées des consensus, donc peu efficace.
p.21
Rôle des promoteurs et terminateurs
Existe-t-il des promoteurs naturels contenant tous les éléments parfaits?
Non, aucun promoteur naturel ne contient tous les éléments parfaits.
p.26
Initiation et élongation de la transcription
Quel est le premier événement du cycle de transcription?
Fixation de l'ARN polymérase sur les éléments du promoteur.
p.26
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce qui se forme après la fixation de l'ARN polymérase sur le promoteur?
Un complexe stable appelé complexe fermé.
p.24
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quel est le rôle de l'ARN polymérase contenant σ70?
Interagir avec le promoteur.
p.27
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quel est le rôle de la reconnaissance du promoteur dans le cycle de transcription?
Elle permet la formation du complexe fermé (RPc).
p.27
Initiation et élongation de la transcription
Que signifie 'RPi' dans le contexte du cycle de transcription?
RPi représente le complexe intermédiaire formé lors de l'enroulement de l'ADN autour de l'ARN polymérase.
p.17
Initiation et élongation de la transcription
Quel est le rôle de la sous-unité σ dans l'ARN polymérase ?
Elle permet à l'ARN polymérase d'initier la transcription.
p.18
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quel est le rôle du facteur σ principal dans une bactérie?
Il est responsable de la majorité de la transcription.
p.17
Initiation et élongation de la transcription
Quel est le rôle de l'holoenzyme dans la transcription ?
Elle est impliquée dans l'initiation de la transcription.
p.17
Initiation et élongation de la transcription
Quel est le rôle du core enzyme dans la transcription ?
Il est impliqué dans l'élongation et la terminaison de la transcription.
p.18
ARN polymérases et leur fonctionnement
Combien de facteurs σ différents sont présents chez Escherichia coli?
Il y a 7 facteurs σ différents.
p.21
Rôle des promoteurs et terminateurs
Qu'est-ce qu'un promoteur « fort »?
Un promoteur avec des séquences proches des consensus, donc très efficace.
p.20
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelles sont les deux régions conservées dans les séquences consensus du promoteur chez les procaryotes?
Région -35 et région -10.
p.23
Rôle des promoteurs et terminateurs
Où sont localisés les éléments « UP » dans les promoteurs ?
En amont de la séquence -35.
p.23
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelle est la fonction des éléments « UP » dans les promoteurs ?
Renforcer l'interaction entre l'ARN polymérase et l'ADN.
p.24
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quels sont les composants de l'ARN polymérase illustrés dans le schéma?
Les composants αCTD, αNTD, β, β', et σ.
p.22
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelle est la séquence consensus de la région -35 d'un promoteur bactérien de type σ70?
La séquence consensus de la région -35 est TTGACA.
p.22
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelle est la fonction du promoteur dans la transcription?
Le promoteur est une région non transcrite de l'ADN qui permet l'initiation de la transcription par l'ARN polymérase.
p.28
Transcription de l'ADN en ARN
Que se passe-t-il lors de la séparation des brins d'ADN?
La formation de la « bulle » de transcription.
p.25
Transcription de l'ADN en ARN
Qu'est-ce que la transcription?
Une réaction très conservée entre procaryotes et eucaryotes.
p.31
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il avant le passage à l'étape d'élongation lors de la transcription par l'ARN polymérase ?
Synthèse et relarguage par l'ARN polymérase d'un ensemble de transcrits « avortés ».
p.31
Initiation et élongation de la transcription
Quelle est la longueur typique des transcrits « avortés » synthétisés par l'ARN polymérase ?
Souvent entre 2 et 12 nucléotides, mais parfois jusqu'à 15 ou 17 nucléotides.
p.31
Initiation et élongation de la transcription
L'ARN polymérase se dissocie-t-elle pendant l'initiation « avortée » ?
Non, il n'y a pas de dissociation de l'ARN polymérase pendant cette initiation « avortée ».
p.32
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il lors de la libération du promoteur chez les procaryotes?
Le facteur sigma se détache.
p.25
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que le complexe ouvert (RP2)?
Le complexe formé lorsque l'ADN est déroulé pour permettre la transcription.
p.30
Initiation et élongation de la transcription
Quelles sont les étapes du cycle de transcription?
Reconnaissance du promoteur, isomérisation, initiation.
p.33
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce qui démarre la phase d'élongation de la transcription?
La progression de l'ARN polymérase le long de l'ADN.
p.30
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce qui initie la synthèse de l'ARN?
La présence de NTP (nucléoside triphosphates).
p.34
Initiation et élongation de la transcription
Comment l'extrémité 3' de l'ARN naissant interagit-elle avec le brin matrice?
L'extrémité 3' de l'ARN naissant s'apparie avec le brin matrice sur environ 7-8 nucléotides.
p.24
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quels sont les éléments du promoteur avec lesquels l'ARN polymérase σ70 interagit?
Les éléments -35, -10 et l'élément étendu -10.
p.22
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelle est la séquence consensus de la région -10 d'un promoteur bactérien de type σ70?
La séquence consensus de la région -10 est TATAAT.
p.22
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la différence entre le brin codant et le brin matrice?
Le brin codant (ou complémentaire) est la séquence d'ADN qui correspond à l'ARN transcrit, tandis que le brin matrice est utilisé comme modèle pour la synthèse de l'ARN.
p.28
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que l'isomérisation dans le cycle de transcription?
La transformation du complexe fermé (RPc) en complexe ouvert (RPo).
p.25
Initiation et élongation de la transcription
Quel est le rôle de l'holoenzyme dans la transcription?
Elle se lie à l'ADN pour initier la transcription.
p.29
Initiation et élongation de la transcription
Quelle région de l'ADN est dénaturée après la fixation de l'ARN polymérase?
Environ de la position -12 à +3, incluant la région -10.
p.25
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il lors de l'élongation de la transcription?
L'ARN polymérase ajoute des nucléotides à la chaîne d'ARN en croissance.
p.25
Mécanismes de terminaison de la transcription
Qu'est-ce que la terminaison de la transcription?
Le processus par lequel l'ARN polymérase cesse de transcrire l'ADN et libère l'ARN nouvellement synthétisé.
p.25
Initiation et élongation de la transcription
Quel est le rôle du facteur sigma dans la transcription?
Il aide l'ARN polymérase à reconnaître les promoteurs et à initier la transcription.
p.33
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il avec l'ARN polymérase lors de la libération du promoteur?
L'ARN polymérase se désengage du promoteur.
p.30
Rôle des promoteurs et terminateurs
Que se passe-t-il lors de la reconnaissance du promoteur?
Formation du complexe fermé (RPc).
p.34
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que l'élongation dans le contexte de la transcription de l'ADN?
L'élongation est le processus par lequel l'ARN polymérase ajoute des nucléotides à l'extrémité 3' de l'ARN naissant, en utilisant le brin matrice d'ADN comme modèle.
p.34
Initiation et élongation de la transcription
Quel est le rôle de l'extrémité 5' de l'ARN naissant pendant l'élongation?
L'extrémité 5' de l'ARN naissant passe dans un canal présent dans l'ARN polymérase, appelé canal de sortie de l'ARN, qui couvre environ 7 nucléotides.
p.35
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quel est le rôle de l'activité nucléase de l'ARN polymérase?
Corriger les erreurs en éliminant le mauvais nucléotide.
p.35
Initiation et élongation de la transcription
Quelles sont les étapes de la correction des erreurs lors de la transcription?
Blocage de l'élongation, activation de l'activité nucléase, et synthèse.
p.36
Initiation et élongation de la transcription
Comment GreA et GreB facilitent-elles la correction des erreurs de transcription?
En se fixant sur l'ARN polymérase, en contact avec l'ARN naissant, et en activant l'activité nucléase de l'ARN polymérase.
p.36
Initiation et élongation de la transcription
Quelle est la différence entre GreA et GreB en termes de clivage des nucléotides?
GreA clive 2-3 nucléotides, tandis que GreB peut cliver jusqu'à 18 nucléotides.
p.40
Mécanismes de terminaison de la transcription
Qu'est-ce qui émerge du canal de sortie lors de la formation de la structure tige boucle?
La structure tige boucle.
p.40
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quel type de terminaison est illustré dans le document?
La terminaison Rho-indépendante.
p.37
Mécanismes de terminaison de la transcription
Que se passe-t-il lors de la terminaison de la transcription?
Dissociation du complexe ADN-ARN-ARN polymérase.
p.39
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quel est l'effet de la formation de la tige boucle et de la série de U sur l'ARN polymérase?
Cela provoque la pause et le décrochage de l'ARN polymérase, arrêtant ainsi la transcription.
p.39
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quelles sont les deux étapes principales de la terminaison Rho-indépendante?
La formation d'une tige boucle et la déstabilisation du complexe ADN-ARN-ARNp.
p.42
Mécanismes de terminaison de la transcription
Qu'est-ce que la terminaison Rho-dépendante?
Un mécanisme de terminaison de la transcription où la protéine Rho interagit avec l'ARN pour arrêter la transcription.
p.24
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quels éléments sont présents en amont et en aval du promoteur dans l'interaction avec l'ARN polymérase σ70?
Les éléments UP et les régions en aval.
p.22
Rôle des promoteurs et terminateurs
Qu'est-ce qu'un promoteur bactérien de type σ70?
Un promoteur bactérien de type σ70 est une séquence d'ADN qui permet l'initiation de la transcription chez les bactéries.
p.22
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelles sont les régions clés d'un promoteur bactérien de type σ70?
Les régions clés sont la région -35 (TTGACA) et la région -10 (TATAAT).
p.28
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelle est la première étape du cycle de transcription?
La reconnaissance du promoteur.
p.22
Initiation et élongation de la transcription
Quelle est la direction de la transcription par rapport au promoteur?
La transcription commence au site d'initiation (+1) et se déroule en direction 5' vers 3' de l'ARN.
p.29
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il après la fixation de l'ARN polymérase?
Séparation (dénaturation) des deux brins d'ADN, formation d'une bulle de transcription.
p.25
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que le complexe de transcription initial (ITC)?
Le complexe formé au début de la transcription avant l'élongation.
p.32
Initiation et élongation de la transcription
Quelles sont les étapes du cycle de transcription?
Reconnaissance du promoteur, isomérisation, initiation, évasion, élongation.
p.33
Initiation et élongation de la transcription
Quelle est la dernière étape de l'initiation de la transcription?
La libération du promoteur.
p.32
Initiation et élongation de la transcription
Quelle est la fonction de l'ARN polymérase pendant l'élongation?
Elle progresse le long de l'ADN.
p.25
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que le complexe fermé (RP1)?
Le complexe formé avant que l'ADN ne soit déroulé pour la transcription.
p.30
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que l'isomérisation dans le cycle de transcription?
Transition du complexe fermé (RPc) au complexe ouvert (RPo).
p.35
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il lors de l'incorporation d'un mauvais nucléotide pendant la transcription?
Blocage de l'élongation (pause).
p.35
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quelle activité est activée suite à l'incorporation d'un mauvais nucléotide?
Une activité nucléase de l'ARN polymérase.
p.36
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il lors de l'incorporation d'un mauvais nucléotide pendant la transcription?
Blocage de l'élongation (pause) et activation d'une activité nucléase de l'ARN polymérase.
p.37
Rôle des promoteurs et terminateurs
Quelle est la première étape du cycle de transcription?
Reconnaissance du promoteur.
p.39
Mécanismes de terminaison de la transcription
Qu'est-ce que la terminaison Rho-indépendante?
C'est un mécanisme de terminaison de la transcription où une tige boucle riche en G et C se forme dans le transcrit, suivie d'une série de U, provoquant la pause et le décrochage de l'ARN polymérase.
p.42
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quel est le rôle de l'ATP dans la terminaison Rho-dépendante?
L'ATP est utilisé pour la translocation de la protéine Rho le long de l'ARN.
p.41
Mécanismes de terminaison de la transcription
Combien de sous-unités identiques composent la protéine Rho?
6 sous-unités identiques formant un anneau.
p.44
Transcription de l'ADN en ARN
Qu'est-ce que le +1 de transcription?
Le +1 de transcription est le site où commence la transcription de l'ADN en ARN.
p.41
Mécanismes de terminaison de la transcription
Sur quel site la protéine Rho se fixe-t-elle?
Sur un site appelé rut (rho utilization site).
p.44
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la direction de la transcription de l'ADN en ARN?
La transcription se fait dans la direction 5' vers 3'.
p.41
Mécanismes de terminaison de la transcription
Comment la protéine Rho progresse-t-elle le long du transcrit?
La progression de Rho le long du transcrit nécessite l'hydrolyse de l'ATP.
p.34
Initiation et élongation de la transcription
Quel mouvement se produit dans le complexe pendant l'élongation?
Il y a un mouvement de l'ADN dans le complexe pendant l'élongation.
p.38
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quels sont les deux mécanismes de terminaison de la transcription chez les procaryotes?
Terminaison dépendante d'un facteur intrinsèque et terminaison dépendante d'un facteur extrinsèque.
p.40
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quelle interaction est faible lors de la formation de la structure tige boucle?
L'interaction entre l'extrémité 3' de l'ARN et le brin ADN matrice.
p.40
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quels sont les éléments clés de la terminaison Rho-indépendante?
La formation de la structure tige boucle et l'interaction faible entre l'extrémité 3' de l'ARN et le brin ADN matrice.
p.39
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quelle structure se forme dans le transcrit lors de la terminaison Rho-indépendante?
Une tige boucle riche en G et C.
p.42
Mécanismes de terminaison de la transcription
Que se passe-t-il lorsque la protéine Rho atteint la polymérase?
La polymérase est mise en pause et la transcription est terminée.
p.42
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quelle est la conséquence de la terminaison Rho-dépendante sur l'ARN nouvellement synthétisé?
L'ARN est libéré de la polymérase et la transcription est terminée.
p.41
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quelles sont les caractéristiques du site rut?
Région de 40 à 60 nucléotides sur le transcrit, riche en C, simple brin.
p.44
Rôle des promoteurs et terminateurs
Comment identifier si une séquence d'ADN est transcrite?
En analysant la présence de promoteurs et de séquences spécifiques qui indiquent le début de la transcription.
p.44
Différences entre ARN et ADN
Quelle est la différence entre les brins 5' et 3' dans l'ADN?
Le brin 5' est le brin sens, et le brin 3' est le brin antisens qui sert de modèle pour la transcription.
p.43
Initiation et élongation de la transcription
Quels sont les trois complexes principaux dans le cycle de transcription?
Complexe fermé, complexe intermédiaire, complexe ouvert.
p.43
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il dans le complexe fermé (RPc) du cycle de transcription?
L'ARN polymérase (RNAP) se lie à l'ADN.
p.43
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il après l'initiation dans le cycle de transcription?
L'élongation commence, où l'ARN est protégé dans le canal de l'ARN polymérase (RNAP).
p.43
Mécanismes de terminaison de la transcription
Qu'est-ce que la terminaison dans le cycle de transcription?
C'est le processus où la transcription se termine et l'ARN polymérase (RNAP) se dissocie de l'ADN.
p.45
Initiation et élongation de la transcription
Comment déterminer le site d'initiation de la transcription ?
Par identification expérimentale de l'extrémité 5' du transcrit.
p.45
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que la cartographie à la nucléase S1 ?
Une méthode pour déterminer le site d'initiation de la transcription en identifiant l'extrémité 5' du transcrit.
p.49
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quelle est la méthode utilisée pour déterminer le +1 de transcription?
Cartographie à la nucléase S1.
Quelle est l'orientation des brins d'ADN dans la cartographie à la nucléase S1?
5' à 3' pour le brin supérieur et 3' à 5' pour le brin inférieur.
p.47
Transcription de l'ADN en ARN
Que signifie le terme 'blot' dans la technique du Northern-blot?
Transfert sur membrane (buvardage).
p.50
Mécanismes de terminaison de la transcription
Comment le positionnement du +1 est-il déterminé?
Par la détection de la diminution de taille de l'ADN marqué.
p.51
Rôle des promoteurs et terminateurs
Qu'est-ce que le site d'initiation dans la transcription de l'ADN?
Le site d'initiation est l'endroit où commence la transcription de l'ADN en ARN.
p.48
Synthèse in vitro d’un ARN anti-sens marqué
Qu'est-ce que la synthèse in vitro d'un ARN anti-sens marqué?
La création en laboratoire d'un ARN anti-sens avec une étiquette ou un marqueur.
p.48
Hybridation avec les ARNs
Quel est le but de l'hybridation avec les ARNs?
Permettre l'appariement entre l'ARN anti-sens marqué et les ARNs cibles.
p.48
Digestion par la RNAse
Que se passe-t-il lors de la digestion par la RNAse?
La RNAse digère les ARNs non appariés, laissant les ARNs marqués protégés.
Comment détecte-t-on l'ARN marqué après électrophorèse?
L'ARN marqué est détecté s'il est protégé par appariement avec le transcrit.
p.52
Initiation et élongation de la transcription
Comment détermine-t-on la position du +1 de transcription?
En détectant et en mesurant la taille de l'ARN marqué synthétisé.
p.42
Mécanismes de terminaison de la transcription
Où se fixe la protéine Rho pour initier la terminaison Rho-dépendante?
Sur le site rut de l'ARN.
p.41
Mécanismes de terminaison de la transcription
Qu'est-ce qui provoque l'arrêt de la transcription dans la terminaison Rho-dépendante?
Le contact entre Rho et l'ARN polymérase provoque l'arrêt de la transcription.
p.43
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il dans le complexe ouvert (RPo) du cycle de transcription?
L'initiation de la transcription commence avec la synthèse de la première liaison phosphodiester.
p.46
Transcription de l'ADN en ARN
Qu'est-ce que la détection d'un ARN par Northern-blot nécessite?
L'utilisation d'une sonde pour la détection spécifique de l'ARN d'intérêt.
p.46
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la fonction d'une sonde oligonucléotidique dans la détection d'un ARN par Northern-blot?
Elle est complémentaire d'une région de la séquence d'intérêt pour permettre une détection spécifique.
p.45
Initiation et élongation de la transcription
Quelles méthodes peuvent être utilisées pour identifier l'extrémité 5' du transcrit ?
Cartographie à la nucléase S1, extension d'amorce, transcription in vitro (type Run off).
p.45
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que la transcription in vitro (type Run off) ?
Une méthode pour déterminer le site d'initiation de la transcription en identifiant l'extrémité 5' du transcrit.
p.50
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quelle est la méthode utilisée pour déterminer le +1 de transcription?
Cartographie à la nucléase S1.
p.50
Transcription de l'ADN en ARN
Quel est le premier étape de la cartographie à la nucléase S1?
Hybridation des ARNs et du fragment d'ADN marqué.
p.50
Mécanismes de terminaison de la transcription
Que se passe-t-il après l'hybridation des ARNs et du fragment d'ADN marqué?
Digestion à la nucléase S1.
p.47
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la fonction de la sonde marquée dans la technique du Northern-blot?
Hybridation avec l'ARN cible pour la détection.
p.47
Transcription de l'ADN en ARN
Quels sont les trois résultats obtenus grâce à la technique du Northern-blot?
Détection de l'ARN, détermination de la taille de l'ARN, estimation de la quantité de transcrit.
p.51
Initiation et élongation de la transcription
Quel est le rôle de la transcriptase réverse dans la détermination du +1 de transcription?
La transcriptase réverse synthétise l'ADN à partir de l'ARN pour déterminer la taille de l'ADN synthétisé.
p.52
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que le site d'initiation dans la transcription in vitro?
Le site où commence la transcription sur un fragment d'ADN de taille connue.
p.51
Initiation et élongation de la transcription
Quelle est la direction de l'extension de l'amorce dans la transcription?
L'extension de l'amorce se fait dans la direction 3' vers 5'.
p.51
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce qu'un oligonucléotide dans le contexte de la transcription?
Un oligonucléotide est une courte séquence d'ADN ou d'ARN utilisée comme amorce pour la synthèse d'ADN.
p.48
Estimation de la quantité de transcrit
Comment estime-t-on la quantité de transcrit?
En détectant la quantité d'ARN marqué après électrophorèse.
p.41
Mécanismes de terminaison de la transcription
Y a-t-il un point précis de terminaison pour la terminaison Rho-dépendante?
Non, il n'y a pas de point précis de terminaison, c'est un site où l'ARN polymérase pause.
p.43
Initiation et élongation de la transcription
Que se passe-t-il dans le complexe intermédiaire (RPi) du cycle de transcription?
L'ARN polymérase (RNAP) commence à ouvrir l'ADN pour former un hybride ARN:ADN.
p.43
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que l'initiation abortive dans le cycle de transcription?
C'est un processus où de courts segments d'ARN sont synthétisés et relâchés avant que l'élongation ne commence.
p.45
Transcription de l'ADN en ARN
Comment peut-on visualiser un transcrit et le quantifier ?
Par Northern-blot et protection à la RNAse.
p.45
Transcription de l'ADN en ARN
Quels sont les deux méthodes mentionnées pour quantifier un transcrit ?
Northern-blot et protection à la RNAse.
p.46
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la direction de la sonde oligonucléotidique par rapport à l'ARN cible?
La sonde est complémentaire et s'aligne de 3' à 5' par rapport à l'ARN cible.
p.45
Initiation et élongation de la transcription
Qu'est-ce que l'extension d'amorce ?
Une méthode pour déterminer le site d'initiation de la transcription en identifiant l'extrémité 5' du transcrit.
p.49
Mécanismes de terminaison de la transcription
Quel fragment est utilisé pour recouvrir le +1 de transcription?
Un fragment d'ADN marqué.
p.47
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la première étape de la technique du Northern-blot?
Extraction des ARNs totaux de la cellule.
p.47
Liaisons phosphodiester dans l'ARN
Comment les ARNs sont-ils séparés lors de la technique du Northern-blot?
Par électrophorèse en fonction de leur taille.
p.47
Transcription de l'ADN en ARN
Comment la détection de l'ARN est-elle réalisée si la sonde est radioactive?
Par révélation avec un autoradiogramme.
p.51
Transcription de l'ADN en ARN
Quelle est la direction de la synthèse de l'ARN?
La synthèse de l'ARN se fait dans la direction 5' vers 3'.
p.51
Initiation et élongation de la transcription
Comment la taille de l'ADN synthétisé est-elle déterminée?
La taille de l'ADN synthétisé est déterminée après électrophorèse.
p.52
ARN polymérases et leur fonctionnement
Quel est le rôle de l'ARN polymérase purifiée ou de l'extrait cellulaire dans la transcription in vitro?
Ils sont utilisés pour synthétiser l'ARN à partir du fragment d'ADN.
p.52
Transcription de l'ADN en ARN
Pourquoi utilise-t-on des nucléotides marqués dans la transcription in vitro?
Pour détecter et déterminer la taille de l'ARN synthétisé.
